La Congregación de las Hijas de María Auxiliadora (FMA), fundada por San Juan Bosco y Santa María Mazzarello el 5 de agosto de 1872 en Mornese, Italia, nació para brindar educación y formación cristiana a niñas y jóvenes necesitadas. Llegó al Perú en 1891 y estableció su primera obra educativa, el Instituto Sevilla en el Rímac. En 1902 fundó el Colegio María Auxiliadora de Breña, su obra más representativa, con más de 120 años de servicio educativo. Inició con el nivel primaria, se incorporó la secundaria en 1926. En 1934 se inauguró su capilla y entre 1956 y 2000 coexistió con una escuela gratuita en el mismo local. Desde 1983 cuenta con dos comunidades: el colegio y la Casa Inspectorial Santa Rosa. Durante estos años 26 directoras asumieron la continuidad de la propuesta educativa, afrontando diferentes retos. Actualmente, bajo la dirección de Sor Evelyn Díaz Barriga (2025), el colegio continúa su misión salesiana en favor de la juventud peruana.